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大石林由密集的石峰组成，有如一片石盆地。这里的石林直立突兀，线条顺畅，并呈淡淡的青灰色，最高大的独立岩柱高度超过40米。其中有“莲花峰”、“剑峰池”、“千钧一发”、“极狭通人”、“象距石台”、“幽兰深谷”、“凤凰梳翅”等典型景点，最著名的当数龙云题词“石林”之处的“石林胜境”，而“望峰亭”为欣赏“林海”的最佳处。人们行走在峰林间，不几步便被石峰挡道，曲折迂回之后，又是另一种天地。

小石林与密集的大石林相比，邻近的小石林便显得疏朗、清雅、秀美。宽厚墩实的石壁像屏风一样，将小石林分割成若干园林。小石林中最有名气的景点当数“阿诗玛”，当夜幕降临，彩灯映照，更是五彩斑斓，妩媚动人。

李子园箐在环林路以外，方圆数十里的荒山野丘上，布满了奇柱异石，有聚有散，有起有伏，而且没有过多的高树与石林争高，保持着自然的风貌，身处其间，感受与大、小石林截然不同，全然一种原始和仓莽。在环林路东南约300米处的丛林石壁上，有一片古崖画，画着奔放粗犷的人、兽、物、星月等图像，据有关专家考证后认为，这属原始宗教内容，与广西左江崖画的人物极为相似。

万年灵芝紧邻李子园箐的比目潭旁，石山顶上有一座高约15米的石峰，上大下小，犹如一朵巨大的灵芝，因而得名。夕阳西下，立于灵芝山顶，颇有“一揽众山小”的惬意之感。

长湖是溶岩湖，湖水由地下水供给，周长5千米，宽300米，平均深度24米，水质清澈，无污染。四面青山环抱，植物覆盖率达95%以上。空气清新洁净，透明度好。湖中有小岛，湖岸是以云南松为主的森林，地势平缓，分由众多小湖，环境清净幽美。它座落在海拔1907米的群山环抱之中。湖平面形状如身材修长的少女，是民间传说中阿诗玛的故乡，因湖体掩藏在青山翠岗之中，以往游人足迹罕至，故又被人们称为“藏湖”。

步哨山位于大石林之东，小石林之南，以景区环林东路为界，呈南北向带状展布，地貌上属大石林溶蚀洼地东部斜坡平台。因清末石林彝民义军首领赵发曾在此山驻防，设步哨巡山而得名。山顶海拔1796.7m，高出大石林望峰亭近50m，为石林景区海拔最高处。登高远望，林海松涛，柱石参差；漫步山间，石林卓越，剑峰罗列。区内多柱状石林，有“步哨五石门”、“步哨松涛”等独特景观。景点中有巨型腹足类化石、珊瑚化石等海洋生物化石，记录着2.7亿年前石林地区生机勃发的海底世界。

奇风洞是一个会“呼吸”的山洞。在石林县诸多溶洞中，数它最奇特。洞中虽不大，直径约1米，但每到雨季，洞内便会发出像老牛喘气一般的声音。有人故意用泥巴封住洞口，它也能毫不费力地把泥巴吹开，若在洞口燃起干柴，洞中的风便把火苗浓烟吹腾飞扬，停歇10多分钟之后，又开始吸气，烟火又被“吞入”洞内，如此一呼一吸，循环往复不绝。奇风洞的呼吸现象并非四季常有，通常发生在6—10月间。奇风洞尚未开发，属储备景点。

芝云洞在大小石林西北6公里，安石公路东侧的一座石灰岩大石山中。洞长400为，宽3—15米，高5—30米，呈“丫”形，两段洞由一低矮狭窄的洞门连为一体。洞内多石钟乳、石笋、石柱等溶洞景观。形态多样，异彩纷呈。明以后称“仙迹胜景”，以“石硐仙踪”之名号独居石林八景之首。

乃古石林位于石林景区北部，距大小石林景区8公里，面积约30平方公里，是云南石林世界自然遗产的核心区。该区域石柱高大密集，最高的石柱达40余米，多呈城堡状、塔状、蘑菇状。石柱间呈现塌陷、溶洼或溶斗形态，与地下洞穴交互出现，或与暗河交织，时隐时现，构成了奇峰、溶洞、湖泊等一系列喀斯特地貌奇观。
组成乃古石林的地层为二叠纪茅口组下部的白云灰质岩、生物碎屑灰岩和砾屑灰岩，以及楼霞组顶部的条带状白云质灰岩，地质年代比大小石林更为古老。通常白云质灰岩因为比纯灰岩抗溶蚀的能力强，因而难以达到溶蚀的极端形态——以尖顶和锋利溶痕为特征的剑状喀斯特。 然而乃古石林由于其特殊的原因，却发育了完美的剑状喀斯特。乃古石林整体呈黑色，石柱高大密集，远望似高墙古堡，古朴粗旷、雄伟壮观，无论是石林本身还是与周围环境一起，都展现了一流的自然美。

云南人将瀑布称为“叠水”，石林大叠水又名“飞龙瀑”，位于石林县西南端，距离县城25公里，为南盘江的支流巴江跌落而形成。巴江奔流千里，在路南盆地蜿蜒流淌了30多公里并穿越一段峡谷，流经石林县境内一个叫“板桥”的村庄后，岩层骤断，悬岩壁立，高达百丈，水从悬岩奔跌而下，跳过三跌岩石，倾入崖底潭中，激起阵阵轰鸣，声振山谷，形成“叠水喷霞”的自然奇观。由于南盘江为珠江上游水系，因而大叠水又被称为“珠江第一瀑”，瀑布落差88米、宽30余米，为云南最大的瀑布。
大叠水瀑布在地质上属地貌裂点，是断块差异升降的结果，即一条东西向的断裂从这里通过，使北面相对抬升，南面相对下降，形成悬崖。此悬崖的存在阻止了下游河流的溯源侵蚀，从而使路南盆地的水文格局和石林地貌得以保持。

月湖位于石林景区东北12公里处的月湖村是云南省民族文化生态村，而月湖便与之毗邻，其海拔为1906米，平均深18米，是石林高原断陷湖中最大的一个湖泊。月湖呈新月形，水面宽广又不太深，因而盛产鱼。在月湖垂钓一般都会收获颇丰，湖岸的石层里藏有许多珊瑚、螺蛳、蛤蜊等海生化石。月湖的南岸是石灰岩质的石山，刚露土的石芽让人叹为奇观。湖北岸是绿色的草坪。湖东岸山峦起伏，树木葱茏，彝族村风光秀丽。环湖的小山上，种着青松翠柏，生长着芦草。游客在长湖可乘竹排漂流，或垂钓，或登山领略湖光山色，还可享受湖畔露营的野趣。

清水塘—石厢子石林位于石林公园中部开阔起伏的溶丘洼地地形，石林成片分布于山顶、斜坡、洼地和湖泊之中。由于大部处于自然状态，展现了丰富的高原石林喀斯特景观。这里可以同时看到形成于不同时期的石林，有刚从玄武岩盖层下出露的早二叠世石林；有从早第三纪湖泊沉积层下再次出露的始新世石林；有位于山顶，第三纪以来一直出露，现已稀疏的残余石林；也有位于水中，正在发育形成的现代石林。这里是展示石林“世代”关系及不同地貌特征的理想场所。