穿洞天坑是飞猫洞地下河系统洞顶崩塌贯通地表而形成。它是由六座山峰围成，峰体标高1280～1381米。坑口长370米，宽270米，天坑深度312米，坑底面积3万平方米，容积1172万立方米。天坑西南端绝壁下发育有直径为70米、高达113米的厅堂式洞穴—---半月洞，东北端绝壁下分布有可测长度为147米的梭子洞，西南绝壁与长度为202米的穿洞相连，通过穿洞可轻易地步入天坑。

穿洞坑底森林密布，为常绿性森林群落，共有75科158种植物，生长有掌叶木、香木莲、短叶黄杉、香果树等国家一、二、三级保护植物和多种兰科植物以及藤本植物,含少量起源古老的蕨类。

穿洞是进入穿洞天坑最便捷的通道，洞口海拔1161米，洞体长202米。洞内分布一定规模的石笋和壁流石。它和附近的熊家东洞、熊家西洞、穿洞天坑、半月洞、梭子洞等均为飞猫洞地下河子系统演化的产物。这些地质遗迹反映了洞道崩塌堆积堵塞是地下河道迁移的一个重要原因。

穿洞天坑是唯一可通过洞穴步入坑底的天坑，目前已对游客开放，是观光旅游、岩溶地学与生物学科研、科普极好场所。